Etude des approches génomiques dans l’estimation du pouvoir métabolique des actinomycètes

Abstract

Les actinomycètes sont des bactéries mycéliennes à Gram positif, généralement saprophytes, hétérotrophes, aérobies, mésophiles et ubiquitaires ; sont rencontrés sur une grande variété de substrats naturels: sols, débris végétaux, sédiments marins, lacs, mers et océans. Ils sont sécrétées les molécules bioactives telles que, les enzymes, les vitamines, les immunosuppresseurs, les insecticides et les herbicides, et les Streptomyces sont les meilleurs candidats pour la production des métabolites secondaires biologiquement actifs. Dans cette recherche, notre objectif est l’étude des différentes approches génomiques qui estiment les métabolites secondaires chez les actinomycètes La plupart des métabolites secondaires des actinomycètes ont été découverts par des méthodes chimiques consistant à modifier les conditions de culture. De nombreux métabolites secondaires sont exprimés à de faibles niveaux au cours de la croissance en laboratoire. La découverte de nouveaux métabolites secondaires s'est avérée difficile. Cette limitation a été surmontée par une approche d'exploration du génome, dans laquelle les progrès récents de la technologie de séquençage de l'ADN et à l’aide des outils bio-informatiques (antiSMASH, BLAST, NP searcher.. etc) ont entraîné une augmentation rapide du nombre de métabolites secondaires de génomes des actinomycètes de haute qualité. A l’issu de ce travail, nous pouvons conclure que les approches génomiques plus important dans l’estimation de pouvoir métabolique des actinomycètes par rapport à la méthode classique